حصہ لینے والی یوٹیلیٹیز کے ذریعہ نمونہ جمع کیا جاتا ہے۔ یہ پروگرام ہمارے یوٹیلیٹی پارٹنرز پر اس وقت تک انحصار کرتا ہے جب تک کہ نمونے کو لیبارٹری، DCLS میں نقل و حمل کے لیے نہیں اٹھایا جاتا۔
نمونے کی دو اہم قسمیں ہیں جو جمع کیے جاتے ہیں: نمونے پکڑو اور جامع نمونے۔
- گراب کے نمونے وقت میں ایک لمحے میں جمع کیے جانے والے ایک ہی نمونے ہیں۔ اس قسم کا نمونہ اس وقت ٹریٹمنٹ پلانٹ میں بہنے والے گندے پانی کا نمائندہ ہوتا ہے جب نمونہ اکٹھا کیا جاتا ہے۔
- جامع نمونے انفرادی نمونے ہیں جو ایک 24گھنٹے کے دورانیے میں اکٹھے کیے جاتے ہیں اور پھر یکجا کرکے ایک نمونہ بناتے ہیں۔ نمونے ایک مقررہ وقت کی بنیاد پر جمع کیے جا سکتے ہیں (مثال کے طور پر، ہر 10 منٹ) یا اس بات پر منحصر ہے کہ گندے پانی کو صاف کرنے والے پلانٹ میں کتنا بہاؤ آتا ہے۔ اس قسم کا نمونہ گندے پانی کی صفائی کے پلانٹ میں بہاؤ کے پورے دن کا نمائندہ ہے۔
یوٹیلیٹی اضافی معلومات (میٹا ڈیٹا) فراہم کرتی ہے جو نمونے کے ساتھ ہوتی ہے جیسے نمونہ جمع کرنے کا وقت، جمع کرنے کے دن کا بہاؤ، اور نمونے لینے کا نقطہ۔ تمام نمونے ٹریٹمنٹ پلانٹ کے داخلی دروازے پر جمع کیے جاتے ہیں اس سے پہلے کہ کوئی اہم پروسیسنگ ہو۔
نمونے DCLS کو ارتکاز، نکالنے، اور قطرہ ڈیجیٹل پولیمریز چین ری ایکشن (ddPCR) کے تجزیہ کے لیے بھیجے جاتے ہیں۔ نومبر کے ہفتے سے پہلے 15 ، 2021 ، نکالے گئے نمونے ddPCR کے ذریعے SARS-COV2 تجزیہ کے لیے ہیمپٹن روڈز سینی ٹیشن ڈسٹرکٹ (HRSD) میں NELAP سے منظور شدہ لیبارٹری میں بھیجے گئے تھے۔ اس رپورٹ میں پیش کردہ جین کا ہدف ddCoV_N ہے، ddPCR گندے پانی کے تجزیہ کے لیے N2 جین کا ایک ترمیم شدہ ورژن[1]. کوانٹیفیکیشن کے نتائج جن کے لیے نو ٹیمپلیٹ کنٹرولز (NTC) میں ایمپلیفیکیشن کا مشاہدہ کیا گیا تھا، تجزیہ سے ہٹا دیا گیا ہے۔ لیبارٹری پروٹوکول کے موجودہ ورژن کے لیے پتہ لگانے کی حد (v2.0) ہے 6,200 کاپیاں/L گندے پانی کی۔ پتہ لگانے کی حد سے نیچے تمام ارتکاز کو پتہ لگانے کی حد کے نصف کے برابر قدر تفویض کی گئی ہے۔
| لیب پروٹوکول ورژن | کھوج کی حد (LOD) | لیبارٹری کی ذمہ داریاں |
| v2 0 | 6,200 | ارتکاز، نکالنا، اور ڈی ڈی پی سی آر تجزیہ: ڈی سی ایل ایس |
| v1 0 | 1,350 | ارتکاز اور اخراج: ڈی سی ایل ایس
قطرہ ڈیجیٹل پولیمریز چین ری ایکشن (ddPCR) تجزیہ: ایچ آر ایس ڈی |
وائرل لوڈ کا حساب مساوات کی بنیاد پر کیا جاتا ہے 1:
(1) وائرل لوڈ (کاپیاں/دن) = وائرل conc. (کاپیاں/L)∗ بہاؤ کی شرح (MGD)∗(3785411.8 L/d)/(1 MGD)
فی سائٹ کی بنیاد پر فی صد کا حساب وائرل لوڈ کے حساب سے کیا جاتا ہے، اور پھر ان کو کوئنٹائلز میں باندھ دیا جاتا ہے (یعنی، 0-19.9ویں، 20-39 9ویں، 40-59 9ویں، 60-79 9واں، 80-100واں)۔ سائٹ کے مخصوص پرسنٹائلز موجودہ ہفتے کے ڈیٹا کا سائٹ کے تاریخی ڈیٹا سے موازنہ کرنے کے لیے ایک میٹرک فراہم کرتے ہیں، جو رنگین تصور کی اجازت دیتا ہے کہ کب ہر سائٹ نے اپنے سب سے زیادہ بمقابلہ کم ترین بوجھ کا تجربہ کیا۔
حوالہ جات
[1] گونزالیز، آر، لارسن، اے، تھامسن، ایچ، کارٹر، ای، اور کاسی، ایکس ایف (2021)۔ گندے پانی کے RT-ddPCR کے لیے SARSCOV2 کلینیکل RT-qPCR اسسیس کو دوبارہ ڈیزائن کرنا۔ https://doi.org/10 ۔ 1101/2021 03 02 21252754